Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssuh2Q8C3L1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssuh2Q8C3L1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssuh2Q8C3L1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssuh2Q8C3L1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssuh2Q8C3L1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssuh2Q8C3L1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssuh2Q8C3L1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssuh2Q8C3L1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ssuh2Q8C3L1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssuh2Q8C3L1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssuh2Q8C3L1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssuh2Q8C3L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssuh2Q8C3L1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssuh2Q8C3L1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssuh2Q8C3L1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssuh2Q8C3L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssuh2Q8C3L1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms