Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TiparpQ8C1B2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TiparpQ8C1B2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TiparpQ8C1B2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TiparpQ8C1B2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TiparpQ8C1B2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TiparpQ8C1B2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TiparpQ8C1B2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TiparpQ8C1B2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TiparpQ8C1B2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TiparpQ8C1B2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TiparpQ8C1B2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TiparpQ8C1B2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TiparpQ8C1B2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TiparpQ8C1B2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TiparpQ8C1B2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TiparpQ8C1B2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TiparpQ8C1B2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TiparpQ8C1B2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TiparpQ8C1B2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TiparpQ8C1B2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TiparpQ8C1B2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TiparpQ8C1B2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TiparpQ8C1B2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TiparpQ8C1B2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TiparpQ8C1B2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TiparpQ8C1B2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms