Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm4aQ8BW72 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm4aQ8BW72 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm4aQ8BW72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm4aQ8BW72 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kdm4aQ8BW72 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdm4aQ8BW72 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Kdm4aQ8BW72 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Kdm4aQ8BW72 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm4aQ8BW72 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kdm4aQ8BW72 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kdm4aQ8BW72 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm4aQ8BW72 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm4aQ8BW72 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm4aQ8BW72 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm4aQ8BW72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm4aQ8BW72 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm4aQ8BW72 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm4aQ8BW72 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm4aQ8BW72 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm4aQ8BW72 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm4aQ8BW72 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm4aQ8BW72 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm4aQ8BW72 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm4aQ8BW72 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm4aQ8BW72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kdm4aQ8BW72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm4aQ8BW72 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm4aQ8BW72 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms