Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Klhl38Q8BSF5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl38Q8BSF5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl38Q8BSF5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klhl38Q8BSF5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl38Q8BSF5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl38Q8BSF5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl38Q8BSF5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl38Q8BSF5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl38Q8BSF5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl38Q8BSF5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl38Q8BSF5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl38Q8BSF5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl38Q8BSF5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl38Q8BSF5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl38Q8BSF5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl38Q8BSF5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl38Q8BSF5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl38Q8BSF5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl38Q8BSF5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl38Q8BSF5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl38Q8BSF5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl38Q8BSF5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl38Q8BSF5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl38Q8BSF5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms