Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8BP99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BP99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BP99 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BP99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BP99 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BP99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BP99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8BP99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BP99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BP99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BP99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BP99 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8BP99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8BP99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8BP99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8BP99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8BP99 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8BP99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BP99 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8BP99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BP99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BP99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BP99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8BP99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8BP99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8BP99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8BP99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8BP99 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8BP99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8BP99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8BP99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8BP99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8BP99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8BP99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8BP99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8BP99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8BP99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8BP99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8BP99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8BP99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8BP99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8BP99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8BP99 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8BP99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8BP99 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8BP99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8BP99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8BP99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8BP99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8BP99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BP99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BP99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8BP99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8BP99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q8BP99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8BP99 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8BP99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8BP99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8BP99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8BP99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q8BP99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BP99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q8BP99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BP99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BP99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BP99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8BP99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8BP99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8BP99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8BP99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8BP99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q8BP99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8BP99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8BP99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8BP99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8BP99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8BP99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8BP99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8BP99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BP99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8BP99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8BP99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8BP99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BP99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8BP99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BP99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BP99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8BP99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BP99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8BP99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8BP99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8BP99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8BP99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8BP99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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