Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLR5

Psd4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd4Q8BLR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psd4Q8BLR5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Psd4Q8BLR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psd4Q8BLR5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psd4Q8BLR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psd4Q8BLR5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psd4Q8BLR5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psd4Q8BLR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psd4Q8BLR5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psd4Q8BLR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psd4Q8BLR5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psd4Q8BLR5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd4Q8BLR5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psd4Q8BLR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psd4Q8BLR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd4Q8BLR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd4Q8BLR5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd4Q8BLR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psd4Q8BLR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psd4Q8BLR5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psd4Q8BLR5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psd4Q8BLR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psd4Q8BLR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psd4Q8BLR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psd4Q8BLR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psd4Q8BLR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psd4Q8BLR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psd4Q8BLR5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psd4Q8BLR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd4Q8BLR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms