Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLB8

Ankrd34c, Ankyrin repeat domain-containing protein 34C, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34cQ8BLB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd34cQ8BLB8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd34cQ8BLB8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd34cQ8BLB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd34cQ8BLB8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd34cQ8BLB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd34cQ8BLB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd34cQ8BLB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd34cQ8BLB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd34cQ8BLB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd34cQ8BLB8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd34cQ8BLB8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd34cQ8BLB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd34cQ8BLB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd34cQ8BLB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd34cQ8BLB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd34cQ8BLB8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd34cQ8BLB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd34cQ8BLB8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd34cQ8BLB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd34cQ8BLB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd34cQ8BLB8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd34cQ8BLB8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd34cQ8BLB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms