Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dupd1Q8BK84 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dupd1Q8BK84 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dupd1Q8BK84 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dupd1Q8BK84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dupd1Q8BK84 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dupd1Q8BK84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dupd1Q8BK84 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dupd1Q8BK84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dupd1Q8BK84 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dupd1Q8BK84 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dupd1Q8BK84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dupd1Q8BK84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dupd1Q8BK84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dupd1Q8BK84 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dupd1Q8BK84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dupd1Q8BK84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dupd1Q8BK84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dupd1Q8BK84 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Dupd1Q8BK84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dupd1Q8BK84 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dupd1Q8BK84 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dupd1Q8BK84 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dupd1Q8BK84 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dupd1Q8BK84 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dupd1Q8BK84 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dupd1Q8BK84 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dupd1Q8BK84 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dupd1Q8BK84 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dupd1Q8BK84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms