Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SynprQ8BGN8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SynprQ8BGN8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SynprQ8BGN8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynprQ8BGN8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynprQ8BGN8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynprQ8BGN8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SynprQ8BGN8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SynprQ8BGN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SynprQ8BGN8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynprQ8BGN8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynprQ8BGN8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynprQ8BGN8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynprQ8BGN8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms