Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actr5Q80US4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actr5Q80US4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actr5Q80US4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actr5Q80US4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Actr5Q80US4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actr5Q80US4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actr5Q80US4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actr5Q80US4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Actr5Q80US4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Actr5Q80US4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Actr5Q80US4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actr5Q80US4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actr5Q80US4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actr5Q80US4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms