Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim12Q78RX3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim12Q78RX3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim12Q78RX3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim12Q78RX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smim12Q78RX3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim12Q78RX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smim12Q78RX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim12Q78RX3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smim12Q78RX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim12Q78RX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim12Q78RX3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim12Q78RX3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim12Q78RX3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim12Q78RX3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim12Q78RX3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim12Q78RX3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim12Q78RX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms