Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Casc1Q6TDU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Casc1Q6TDU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Casc1Q6TDU8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Casc1Q6TDU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Casc1Q6TDU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Casc1Q6TDU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Casc1Q6TDU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Casc1Q6TDU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Casc1Q6TDU8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Casc1Q6TDU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Casc1Q6TDU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Casc1Q6TDU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Casc1Q6TDU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Casc1Q6TDU8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Casc1Q6TDU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Casc1Q6TDU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Casc1Q6TDU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Casc1Q6TDU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Casc1Q6TDU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casc1Q6TDU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Casc1Q6TDU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Casc1Q6TDU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Casc1Q6TDU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casc1Q6TDU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Casc1Q6TDU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casc1Q6TDU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casc1Q6TDU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Casc1Q6TDU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casc1Q6TDU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Casc1Q6TDU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Casc1Q6TDU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms