Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GcsamQ6RFH4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GcsamQ6RFH4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GcsamQ6RFH4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GcsamQ6RFH4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GcsamQ6RFH4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GcsamQ6RFH4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GcsamQ6RFH4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GcsamQ6RFH4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GcsamQ6RFH4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GcsamQ6RFH4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcsamQ6RFH4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GcsamQ6RFH4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GcsamQ6RFH4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GcsamQ6RFH4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcsamQ6RFH4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GcsamQ6RFH4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcsamQ6RFH4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GcsamQ6RFH4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GcsamQ6RFH4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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