Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pabpc4Q6PHQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pabpc4Q6PHQ9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pabpc4Q6PHQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pabpc4Q6PHQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pabpc4Q6PHQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pabpc4Q6PHQ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pabpc4Q6PHQ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pabpc4Q6PHQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pabpc4Q6PHQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc4Q6PHQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pabpc4Q6PHQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pabpc4Q6PHQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc4Q6PHQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pabpc4Q6PHQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pabpc4Q6PHQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pabpc4Q6PHQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pabpc4Q6PHQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pabpc4Q6PHQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pabpc4Q6PHQ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pabpc4Q6PHQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pabpc4Q6PHQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pabpc4Q6PHQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pabpc4Q6PHQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pabpc4Q6PHQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Pabpc4Q6PHQ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Pabpc4Q6PHQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pabpc4Q6PHQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms