Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sec23ipQ6NZC7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sec23ipQ6NZC7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sec23ipQ6NZC7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sec23ipQ6NZC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sec23ipQ6NZC7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sec23ipQ6NZC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sec23ipQ6NZC7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sec23ipQ6NZC7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sec23ipQ6NZC7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sec23ipQ6NZC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sec23ipQ6NZC7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sec23ipQ6NZC7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sec23ipQ6NZC7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sec23ipQ6NZC7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sec23ipQ6NZC7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sec23ipQ6NZC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sec23ipQ6NZC7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sec23ipQ6NZC7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sec23ipQ6NZC7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sec23ipQ6NZC7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sec23ipQ6NZC7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sec23ipQ6NZC7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sec23ipQ6NZC7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sec23ipQ6NZC7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sec23ipQ6NZC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sec23ipQ6NZC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sec23ipQ6NZC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sec23ipQ6NZC7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sec23ipQ6NZC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sec23ipQ6NZC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms