Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PnkdQ69ZP3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PnkdQ69ZP3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PnkdQ69ZP3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PnkdQ69ZP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkdQ69ZP3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkdQ69ZP3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkdQ69ZP3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkdQ69ZP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkdQ69ZP3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkdQ69ZP3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkdQ69ZP3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkdQ69ZP3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkdQ69ZP3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnkdQ69ZP3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnkdQ69ZP3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnkdQ69ZP3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms