Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp4aQ64436 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp4aQ64436 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp4aQ64436 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp4aQ64436 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp4aQ64436 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp4aQ64436 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp4aQ64436 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp4aQ64436 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp4aQ64436 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp4aQ64436 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp4aQ64436 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp4aQ64436 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp4aQ64436 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp4aQ64436 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp4aQ64436 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp4aQ64436 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp4aQ64436 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp4aQ64436 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp4aQ64436 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp4aQ64436 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms