Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sprr1bQ62267 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sprr1bQ62267 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sprr1bQ62267 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sprr1bQ62267 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sprr1bQ62267 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sprr1bQ62267 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sprr1bQ62267 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sprr1bQ62267 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr1bQ62267 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr1bQ62267 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr1bQ62267 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sprr1bQ62267 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sprr1bQ62267 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.9 ms