Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm38Q62176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm38Q62176 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm38Q62176 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm38Q62176 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm38Q62176 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm38Q62176 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbm38Q62176 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbm38Q62176 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm38Q62176 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm38Q62176 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm38Q62176 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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