Protein–RNA interactions for Protein: Q62056

Psg17, MCG130054, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg17Q62056 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psg17Q62056 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psg17Q62056 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psg17Q62056 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psg17Q62056 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psg17Q62056 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psg17Q62056 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psg17Q62056 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psg17Q62056 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psg17Q62056 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psg17Q62056 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psg17Q62056 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psg17Q62056 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psg17Q62056 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psg17Q62056 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms