Protein–RNA interactions for Protein: Q61792

Lasp1, LIM and SH3 domain protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lasp1Q61792 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lasp1Q61792 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lasp1Q61792 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lasp1Q61792 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lasp1Q61792 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lasp1Q61792 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lasp1Q61792 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lasp1Q61792 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lasp1Q61792 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lasp1Q61792 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lasp1Q61792 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lasp1Q61792 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lasp1Q61792 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lasp1Q61792 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lasp1Q61792 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lasp1Q61792 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lasp1Q61792 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lasp1Q61792 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lasp1Q61792 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lasp1Q61792 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lasp1Q61792 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lasp1Q61792 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lasp1Q61792 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lasp1Q61792 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms