Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccne1Q61457 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccne1Q61457 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccne1Q61457 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ccne1Q61457 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccne1Q61457 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccne1Q61457 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccne1Q61457 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ccne1Q61457 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccne1Q61457 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccne1Q61457 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccne1Q61457 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccne1Q61457 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccne1Q61457 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccne1Q61457 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ccne1Q61457 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ccne1Q61457 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccne1Q61457 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccne1Q61457 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccne1Q61457 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccne1Q61457 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccne1Q61457 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccne1Q61457 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccne1Q61457 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccne1Q61457 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccne1Q61457 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccne1Q61457 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccne1Q61457 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccne1Q61457 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccne1Q61457 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccne1Q61457 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccne1Q61457 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccne1Q61457 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccne1Q61457 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccne1Q61457 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccne1Q61457 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccne1Q61457 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms