Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin1Q61142 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin1Q61142 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spin1Q61142 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Spin1Q61142 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spin1Q61142 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin1Q61142 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spin1Q61142 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spin1Q61142 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spin1Q61142 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spin1Q61142 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spin1Q61142 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spin1Q61142 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spin1Q61142 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spin1Q61142 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spin1Q61142 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spin1Q61142 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spin1Q61142 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spin1Q61142 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spin1Q61142 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spin1Q61142 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spin1Q61142 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms