Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd3Q61060 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxd3Q61060 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd3Q61060 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd3Q61060 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd3Q61060 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd3Q61060 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd3Q61060 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd3Q61060 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd3Q61060 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd3Q61060 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd3Q61060 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd3Q61060 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd3Q61060 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd3Q61060 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxd3Q61060 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd3Q61060 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd3Q61060 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd3Q61060 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd3Q61060 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd3Q61060 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd3Q61060 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd3Q61060 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms