Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klf4Q60793 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klf4Q60793 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klf4Q60793 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klf4Q60793 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klf4Q60793 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf4Q60793 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf4Q60793 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klf4Q60793 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf4Q60793 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf4Q60793 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf4Q60793 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf4Q60793 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf4Q60793 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klf4Q60793 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klf4Q60793 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klf4Q60793 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf4Q60793 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf4Q60793 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klf4Q60793 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms