Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Foxd4Q60688 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Foxd4Q60688 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Foxd4Q60688 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Foxd4Q60688 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd4Q60688 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd4Q60688 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Foxd4Q60688 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd4Q60688 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd4Q60688 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd4Q60688 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd4Q60688 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Foxd4Q60688 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Foxd4Q60688 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Foxd4Q60688 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Foxd4Q60688 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Foxd4Q60688 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Foxd4Q60688 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Foxd4Q60688 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms