Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CluhQ5SW19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CluhQ5SW19 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CluhQ5SW19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CluhQ5SW19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CluhQ5SW19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CluhQ5SW19 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CluhQ5SW19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CluhQ5SW19 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CluhQ5SW19 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CluhQ5SW19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CluhQ5SW19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CluhQ5SW19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CluhQ5SW19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CluhQ5SW19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CluhQ5SW19 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CluhQ5SW19 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CluhQ5SW19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CluhQ5SW19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CluhQ5SW19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CluhQ5SW19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CluhQ5SW19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CluhQ5SW19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CluhQ5SW19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CluhQ5SW19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CluhQ5SW19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CluhQ5SW19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CluhQ5SW19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CluhQ5SW19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CluhQ5SW19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CluhQ5SW19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CluhQ5SW19 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CluhQ5SW19 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CluhQ5SW19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CluhQ5SW19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CluhQ5SW19 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms