Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf12Q5SPL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Phf12Q5SPL2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf12Q5SPL2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf12Q5SPL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf12Q5SPL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf12Q5SPL2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf12Q5SPL2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf12Q5SPL2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf12Q5SPL2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf12Q5SPL2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf12Q5SPL2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf12Q5SPL2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf12Q5SPL2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf12Q5SPL2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf12Q5SPL2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf12Q5SPL2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms