Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh12Q5RJH3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh12Q5RJH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdh12Q5RJH3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh12Q5RJH3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh12Q5RJH3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh12Q5RJH3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh12Q5RJH3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh12Q5RJH3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh12Q5RJH3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh12Q5RJH3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh12Q5RJH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh12Q5RJH3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh12Q5RJH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh12Q5RJH3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh12Q5RJH3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh12Q5RJH3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh12Q5RJH3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh12Q5RJH3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh12Q5RJH3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh12Q5RJH3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh12Q5RJH3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh12Q5RJH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh12Q5RJH3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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