Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec4Q497M3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apobec4Q497M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec4Q497M3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec4Q497M3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec4Q497M3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apobec4Q497M3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apobec4Q497M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec4Q497M3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec4Q497M3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec4Q497M3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec4Q497M3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec4Q497M3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec4Q497M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec4Q497M3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec4Q497M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apobec4Q497M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apobec4Q497M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec4Q497M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apobec4Q497M3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apobec4Q497M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apobec4Q497M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apobec4Q497M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec4Q497M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apobec4Q497M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apobec4Q497M3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec4Q497M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms