Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pacs2Q3V3Q7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacs2Q3V3Q7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacs2Q3V3Q7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacs2Q3V3Q7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacs2Q3V3Q7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacs2Q3V3Q7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs2Q3V3Q7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pacs2Q3V3Q7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacs2Q3V3Q7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs2Q3V3Q7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacs2Q3V3Q7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacs2Q3V3Q7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacs2Q3V3Q7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacs2Q3V3Q7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pacs2Q3V3Q7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pacs2Q3V3Q7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pacs2Q3V3Q7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pacs2Q3V3Q7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pacs2Q3V3Q7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms