Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm906Q3V0M1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm906Q3V0M1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm906Q3V0M1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm906Q3V0M1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm906Q3V0M1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm906Q3V0M1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm906Q3V0M1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm906Q3V0M1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm906Q3V0M1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm906Q3V0M1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm906Q3V0M1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm906Q3V0M1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm906Q3V0M1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm906Q3V0M1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm906Q3V0M1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm906Q3V0M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm906Q3V0M1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm906Q3V0M1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm906Q3V0M1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm906Q3V0M1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm906Q3V0M1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm906Q3V0M1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm906Q3V0M1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm906Q3V0M1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm906Q3V0M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm906Q3V0M1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm906Q3V0M1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm906Q3V0M1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms