Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Pde4cQ3UEI1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Pde4cQ3UEI1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Pde4cQ3UEI1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Pde4cQ3UEI1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Pde4cQ3UEI1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Pde4cQ3UEI1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Pde4cQ3UEI1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Pde4cQ3UEI1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Pde4cQ3UEI1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Pde4cQ3UEI1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Pde4cQ3UEI1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Pde4cQ3UEI1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Pde4cQ3UEI1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pde4cQ3UEI1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Pde4cQ3UEI1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Pde4cQ3UEI1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Pde4cQ3UEI1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Pde4cQ3UEI1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Pde4cQ3UEI1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Pde4cQ3UEI1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Pde4cQ3UEI1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Pde4cQ3UEI1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Pde4cQ3UEI1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Pde4cQ3UEI1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Pde4cQ3UEI1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Pde4cQ3UEI1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Pde4cQ3UEI1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Pde4cQ3UEI1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Pde4cQ3UEI1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Pde4cQ3UEI1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Pde4cQ3UEI1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pde4cQ3UEI1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pde4cQ3UEI1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pde4cQ3UEI1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Pde4cQ3UEI1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Pde4cQ3UEI1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Pde4cQ3UEI1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pde4cQ3UEI1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pde4cQ3UEI1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Pde4cQ3UEI1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pde4cQ3UEI1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pde4cQ3UEI1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Pde4cQ3UEI1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Pde4cQ3UEI1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pde4cQ3UEI1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pde4cQ3UEI1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pde4cQ3UEI1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pde4cQ3UEI1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Pde4cQ3UEI1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pde4cQ3UEI1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pde4cQ3UEI1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pde4cQ3UEI1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms