Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
Pde4cQ3UEI1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Pde4cQ3UEI1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Pde4cQ3UEI1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Pde4cQ3UEI1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Pde4cQ3UEI1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Pde4cQ3UEI1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Pde4cQ3UEI1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pde4cQ3UEI1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Pde4cQ3UEI1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Pde4cQ3UEI1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pde4cQ3UEI1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pde4cQ3UEI1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Pde4cQ3UEI1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Pde4cQ3UEI1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Pde4cQ3UEI1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Pde4cQ3UEI1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Pde4cQ3UEI1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Pde4cQ3UEI1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Pde4cQ3UEI1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Pde4cQ3UEI1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Pde4cQ3UEI1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Pde4cQ3UEI1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pde4cQ3UEI1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Pde4cQ3UEI1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Pde4cQ3UEI1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pde4cQ3UEI1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pde4cQ3UEI1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Pde4cQ3UEI1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Pde4cQ3UEI1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Pde4cQ3UEI1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Pde4cQ3UEI1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Pde4cQ3UEI1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Pde4cQ3UEI1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pde4cQ3UEI1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Pde4cQ3UEI1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Pde4cQ3UEI1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Pde4cQ3UEI1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Pde4cQ3UEI1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pde4cQ3UEI1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pde4cQ3UEI1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Pde4cQ3UEI1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Pde4cQ3UEI1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Pde4cQ3UEI1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Pde4cQ3UEI1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Pde4cQ3UEI1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Pde4cQ3UEI1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pde4cQ3UEI1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Pde4cQ3UEI1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Pde4cQ3UEI1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Pde4cQ3UEI1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pde4cQ3UEI1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pde4cQ3UEI1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pde4cQ3UEI1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pde4cQ3UEI1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Pde4cQ3UEI1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Pde4cQ3UEI1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pde4cQ3UEI1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
Pde4cQ3UEI1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pde4cQ3UEI1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Pde4cQ3UEI1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pde4cQ3UEI1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pde4cQ3UEI1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Pde4cQ3UEI1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pde4cQ3UEI1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pde4cQ3UEI1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Pde4cQ3UEI1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Pde4cQ3UEI1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Pde4cQ3UEI1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Pde4cQ3UEI1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Pde4cQ3UEI1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Pde4cQ3UEI1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Pde4cQ3UEI1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Pde4cQ3UEI1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Pde4cQ3UEI1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Pde4cQ3UEI1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Pde4cQ3UEI1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Pde4cQ3UEI1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pde4cQ3UEI1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Pde4cQ3UEI1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Pde4cQ3UEI1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Pde4cQ3UEI1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Pde4cQ3UEI1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Pde4cQ3UEI1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms