Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atxn7l3bQ3UD01 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atxn7l3bQ3UD01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn7l3bQ3UD01 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn7l3bQ3UD01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn7l3bQ3UD01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn7l3bQ3UD01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn7l3bQ3UD01 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn7l3bQ3UD01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn7l3bQ3UD01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn7l3bQ3UD01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn7l3bQ3UD01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn7l3bQ3UD01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn7l3bQ3UD01 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atxn7l3bQ3UD01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms