Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 SOR1YJR159W 1074 nt11.27□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 RTS2YOR077W 699 nt11.27□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 YPL041CYPL041C 624 nt11.27□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 SCC4YER147C 1875 nt11.27□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 YJL107CYJL107C 1164 nt11.24□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 YCL042WYCL042W 360 nt11.23□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 FMP52YER004W 696 nt11.22□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 THP3YPR045C 1413 nt11.21□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 FTH1YBR207W 1398 nt11.21□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 SEC11YIR022W 504 nt11.21□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 FMT1YBL013W 1206 nt11.21□□□□□ -0.61
TFB4Q12004 YDR094WYDR094W 336 nt11.2□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 YLR235CYLR235C 399 nt11.2□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 PAB1YER165W 1734 nt11.2□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 COG1YGL223C 1254 nt11.19□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 FTR1YER145C 1215 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 GIS3YLR094C 1509 nt11.18□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 YKL030WYKL030W 606 nt11.17□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 Q0255Q0255 1419 nt11.16□□□□□ -0.62
TFB4Q12004 PCH2YBR186W 1695 nt11.14□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 LSM12YHR121W 564 nt11.13□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 AIR1YIL079C 1083 nt11.13□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 RSM23YGL129C 1353 nt11.13□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 GUT2YIL155C 1950 nt11.12□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 YEL074WYEL074W 339 nt11.12□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 YIL100WYIL100W 354 nt11.12□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 PTH1YHR189W 573 nt11.11□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 NEM1YHR004C 1341 nt11.09□□□□□ -0.63
TFB4Q12004 YGL188CYGL188C 174 nt11.08□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 KTR3YBR205W 1215 nt11.08□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 ATP6Q0085 780 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.07□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 LCB1YMR296C 1677 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 BNS1YGR230W 414 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 MCH5YOR306C 1566 nt11.05□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 CWP1YKL096W 720 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 STB1YNL309W 1263 nt11.04□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 MOD5YOR274W 1287 nt11.03□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 YTH1YPR107C 627 nt11.03□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 YSC84YHR016C 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
TFB4Q12004 YNL195CYNL195C 786 nt11.02□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YJL225CYJL225C 5277 nt11.02□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt11.01□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 ADH2YMR303C 1047 nt11.01□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YOR169CYOR169C 465 nt11□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.99□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 STD1YOR047C 1335 nt10.99□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YGL118CYGL118C 438 nt10.98□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 YHP1YDR451C 1062 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 AST1YBL069W 1290 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 Q0017Q0017 162 nt10.97□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 PIC2YER053C 903 nt10.96□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 TIM23YNR017W 669 nt10.96□□□□□ -0.65
TFB4Q12004 PCM1YEL058W 1674 nt10.95□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 DIC1YLR348C 897 nt10.94□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 SNF6YHL025W 999 nt10.93□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 REC114YMR133W 1287 nt10.93□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.92□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 YIH1YCR059C 777 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 RNQ1YCL028W 1218 nt10.91□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 YFR018CYFR018C 1092 nt10.9□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 YLR036CYLR036C 612 nt10.9□□□□□ -0.66
TFB4Q12004 YHL050CYHL050C 2094 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 MPC1YGL080W 393 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 YML079WYML079W 606 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 RPM1RPM1 483 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 YBL081WYBL081W 1107 nt10.88□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 RRT12YCR045C 1476 nt10.87□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 HOS2YGL194C 1359 nt10.87□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 YLR179CYLR179C 606 nt10.86□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 YPR064WYPR064W 420 nt10.86□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 RTF1YGL244W 1677 nt10.85□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 NAT5YOR253W 531 nt10.84□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 BOR1YNL275W 1731 nt10.84□□□□□ -0.67
TFB4Q12004 BOP3YNL042W 1191 nt10.83□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 MRPL36YBR122C 534 nt10.83□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 AHT1YHR093W 549 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 TAD3YLR316C 969 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 BNA3YJL060W 1335 nt10.82□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 PUS5YLR165C 765 nt10.81□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 PEX27YOR193W 1131 nt10.81□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 AIM41YOR215C 558 nt10.81□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 ATG17YLR423C 1254 nt10.8□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 WSC2YNL283C 1512 nt10.79□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 RRT5YFR032C 870 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 PAU16YKL224C 372 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 UBC12YLR306W 567 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 AQY1YPR192W 918 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 ICE2YIL090W 1476 nt10.78□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 APM1YPL259C 1428 nt10.77□□□□□ -0.68
TFB4Q12004 ARC19YKL013C 516 nt10.77□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 PIB2YGL023C 1908 nt10.76□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 YNL234WYNL234W 1281 nt10.74□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 ARP6YLR085C 1317 nt10.74□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 YLL053CYLL053C 459 nt10.73□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 PHO92YDR374C 921 nt10.72□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 YMR147WYMR147W 672 nt10.72□□□□□ -0.69
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