Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F13bQ07968 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F13bQ07968 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F13bQ07968 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F13bQ07968 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13bQ07968 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F13bQ07968 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F13bQ07968 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F13bQ07968 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13bQ07968 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
F13bQ07968 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13bQ07968 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13bQ07968 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F13bQ07968 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13bQ07968 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F13bQ07968 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F13bQ07968 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F13bQ07968 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F13bQ07968 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F13bQ07968 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F13bQ07968 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F13bQ07968 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F13bQ07968 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F13bQ07968 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F13bQ07968 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F13bQ07968 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F13bQ07968 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F13bQ07968 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
F13bQ07968 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F13bQ07968 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F13bQ07968 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F13bQ07968 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F13bQ07968 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F13bQ07968 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
F13bQ07968 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F13bQ07968 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F13bQ07968 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F13bQ07968 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
F13bQ07968 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
F13bQ07968 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms