Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Caprin2Q05A80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Caprin2Q05A80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Caprin2Q05A80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Caprin2Q05A80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Caprin2Q05A80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Caprin2Q05A80 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Caprin2Q05A80 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Caprin2Q05A80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Caprin2Q05A80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Caprin2Q05A80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Caprin2Q05A80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Caprin2Q05A80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Caprin2Q05A80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Caprin2Q05A80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Caprin2Q05A80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Caprin2Q05A80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Caprin2Q05A80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Caprin2Q05A80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Caprin2Q05A80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Caprin2Q05A80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Caprin2Q05A80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Caprin2Q05A80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caprin2Q05A80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms