Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r236Q05A06 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r236Q05A06 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r236Q05A06 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r236Q05A06 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r236Q05A06 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r236Q05A06 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r236Q05A06 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r236Q05A06 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r236Q05A06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r236Q05A06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r236Q05A06 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r236Q05A06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r236Q05A06 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r236Q05A06 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r236Q05A06 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r236Q05A06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms