Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Fmn1Q05860 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Fmn1Q05860 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC44.86■■■■■ 4.77
Fmn1Q05860 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Fmn1Q05860 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Fmn1Q05860 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Fmn1Q05860 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
Fmn1Q05860 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
Fmn1Q05860 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Fmn1Q05860 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Fmn1Q05860 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Fmn1Q05860 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Fmn1Q05860 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Fmn1Q05860 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Fmn1Q05860 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Fmn1Q05860 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Fmn1Q05860 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Fmn1Q05860 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Fmn1Q05860 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Fmn1Q05860 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Fmn1Q05860 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Fmn1Q05860 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
Fmn1Q05860 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Fmn1Q05860 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Fmn1Q05860 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Fmn1Q05860 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Fmn1Q05860 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Fmn1Q05860 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Fmn1Q05860 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Fmn1Q05860 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Fmn1Q05860 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Fmn1Q05860 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Fmn1Q05860 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Fmn1Q05860 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Fmn1Q05860 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
Fmn1Q05860 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Fmn1Q05860 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Fmn1Q05860 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Fmn1Q05860 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Fmn1Q05860 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Fmn1Q05860 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Fmn1Q05860 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Fmn1Q05860 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Fmn1Q05860 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
Fmn1Q05860 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Fmn1Q05860 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fmn1Q05860 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fmn1Q05860 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Fmn1Q05860 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Fmn1Q05860 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Fmn1Q05860 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Fmn1Q05860 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Fmn1Q05860 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Fmn1Q05860 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Fmn1Q05860 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Fmn1Q05860 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Fmn1Q05860 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Fmn1Q05860 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Fmn1Q05860 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Fmn1Q05860 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Fmn1Q05860 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Fmn1Q05860 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Fmn1Q05860 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.6 ms