Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Yy1Q00899 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Yy1Q00899 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Yy1Q00899 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Yy1Q00899 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Yy1Q00899 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Yy1Q00899 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Yy1Q00899 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Yy1Q00899 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Yy1Q00899 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Yy1Q00899 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Yy1Q00899 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Yy1Q00899 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Yy1Q00899 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Yy1Q00899 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Yy1Q00899 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Yy1Q00899 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Yy1Q00899 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Yy1Q00899 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Yy1Q00899 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Yy1Q00899 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Yy1Q00899 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Yy1Q00899 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Yy1Q00899 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Yy1Q00899 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Yy1Q00899 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Yy1Q00899 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Yy1Q00899 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Yy1Q00899 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Yy1Q00899 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Yy1Q00899 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Yy1Q00899 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Yy1Q00899 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Yy1Q00899 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Yy1Q00899 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Yy1Q00899 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Yy1Q00899 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Yy1Q00899 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Yy1Q00899 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Yy1Q00899 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Yy1Q00899 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Yy1Q00899 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Yy1Q00899 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Yy1Q00899 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Yy1Q00899 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Yy1Q00899 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Yy1Q00899 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Yy1Q00899 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Yy1Q00899 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Yy1Q00899 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Yy1Q00899 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Yy1Q00899 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Yy1Q00899 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Yy1Q00899 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Yy1Q00899 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Yy1Q00899 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Yy1Q00899 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms