Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr2P98154 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dgcr2P98154 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr2P98154 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dgcr2P98154 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dgcr2P98154 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dgcr2P98154 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dgcr2P98154 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dgcr2P98154 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dgcr2P98154 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dgcr2P98154 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dgcr2P98154 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dgcr2P98154 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dgcr2P98154 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dgcr2P98154 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dgcr2P98154 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dgcr2P98154 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dgcr2P98154 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dgcr2P98154 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms