Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmklr1P97468 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cmklr1P97468 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmklr1P97468 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cmklr1P97468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cmklr1P97468 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cmklr1P97468 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmklr1P97468 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmklr1P97468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmklr1P97468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmklr1P97468 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmklr1P97468 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmklr1P97468 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmklr1P97468 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmklr1P97468 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmklr1P97468 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmklr1P97468 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmklr1P97468 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmklr1P97468 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmklr1P97468 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmklr1P97468 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms