Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp8a1P70704 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8a1P70704 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8a1P70704 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8a1P70704 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8a1P70704 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8a1P70704 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8a1P70704 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8a1P70704 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp8a1P70704 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp8a1P70704 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8a1P70704 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8a1P70704 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8a1P70704 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8a1P70704 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8a1P70704 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8a1P70704 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp8a1P70704 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8a1P70704 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8a1P70704 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp8a1P70704 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp8a1P70704 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8a1P70704 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp8a1P70704 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp8a1P70704 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp8a1P70704 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp8a1P70704 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8a1P70704 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp8a1P70704 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp8a1P70704 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp8a1P70704 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8a1P70704 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8a1P70704 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8a1P70704 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8a1P70704 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms