Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh10P70408 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh10P70408 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh10P70408 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh10P70408 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh10P70408 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh10P70408 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh10P70408 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh10P70408 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh10P70408 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh10P70408 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh10P70408 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh10P70408 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh10P70408 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdh10P70408 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh10P70408 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh10P70408 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh10P70408 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh10P70408 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh10P70408 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh10P70408 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh10P70408 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh10P70408 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh10P70408 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh10P70408 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms