Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Stra8P70278 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Stra8P70278 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Stra8P70278 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Stra8P70278 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Stra8P70278 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Stra8P70278 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Stra8P70278 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Stra8P70278 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Stra8P70278 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Stra8P70278 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Stra8P70278 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Stra8P70278 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Stra8P70278 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Stra8P70278 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Stra8P70278 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Stra8P70278 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Stra8P70278 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Stra8P70278 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Stra8P70278 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Stra8P70278 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Stra8P70278 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Stra8P70278 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Stra8P70278 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Stra8P70278 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Stra8P70278 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Stra8P70278 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Stra8P70278 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Stra8P70278 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Stra8P70278 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Stra8P70278 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Stra8P70278 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Stra8P70278 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Stra8P70278 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Stra8P70278 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Stra8P70278 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Stra8P70278 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Stra8P70278 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Stra8P70278 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Stra8P70278 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Stra8P70278 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Stra8P70278 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Stra8P70278 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Stra8P70278 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms