Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NficP70255 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NficP70255 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NficP70255 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NficP70255 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NficP70255 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NficP70255 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NficP70255 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NficP70255 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NficP70255 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NficP70255 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NficP70255 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NficP70255 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NficP70255 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NficP70255 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NficP70255 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NficP70255 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NficP70255 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NficP70255 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NficP70255 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NficP70255 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NficP70255 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NficP70255 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NficP70255 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NficP70255 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NficP70255 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NficP70255 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NficP70255 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NficP70255 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NficP70255 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NficP70255 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NficP70255 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NficP70255 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NficP70255 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NficP70255 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NficP70255 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NficP70255 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NficP70255 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NficP70255 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NficP70255 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NficP70255 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NficP70255 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NficP70255 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NficP70255 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NficP70255 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NficP70255 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NficP70255 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NficP70255 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NficP70255 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NficP70255 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NficP70255 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NficP70255 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NficP70255 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NficP70255 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NficP70255 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NficP70255 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NficP70255 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NficP70255 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NficP70255 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NficP70255 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NficP70255 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NficP70255 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NficP70255 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NficP70255 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NficP70255 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NficP70255 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NficP70255 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NficP70255 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NficP70255 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NficP70255 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NficP70255 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NficP70255 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NficP70255 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NficP70255 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NficP70255 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NficP70255 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NficP70255 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NficP70255 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NficP70255 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NficP70255 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NficP70255 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NficP70255 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NficP70255 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NficP70255 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NficP70255 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NficP70255 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NficP70255 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NficP70255 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NficP70255 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NficP70255 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NficP70255 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NficP70255 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NficP70255 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NficP70255 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NficP70255 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NficP70255 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NficP70255 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NficP70255 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NficP70255 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NficP70255 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms