Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo1fP70248 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo1fP70248 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo1fP70248 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo1fP70248 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo1fP70248 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo1fP70248 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo1fP70248 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo1fP70248 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo1fP70248 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo1fP70248 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo1fP70248 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo1fP70248 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo1fP70248 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo1fP70248 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo1fP70248 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo1fP70248 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo1fP70248 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo1fP70248 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo1fP70248 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo1fP70248 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo1fP70248 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo1fP70248 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo1fP70248 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo1fP70248 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo1fP70248 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo1fP70248 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo1fP70248 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo1fP70248 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo1fP70248 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo1fP70248 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo1fP70248 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Myo1fP70248 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo1fP70248 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo1fP70248 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo1fP70248 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Myo1fP70248 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Myo1fP70248 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo1fP70248 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo1fP70248 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Myo1fP70248 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo1fP70248 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Myo1fP70248 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo1fP70248 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo1fP70248 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Myo1fP70248 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo1fP70248 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo1fP70248 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Myo1fP70248 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo1fP70248 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo1fP70248 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms