Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps4xP62702 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps4xP62702 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps4xP62702 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps4xP62702 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps4xP62702 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps4xP62702 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps4xP62702 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps4xP62702 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps4xP62702 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps4xP62702 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps4xP62702 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps4xP62702 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps4xP62702 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps4xP62702 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps4xP62702 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps4xP62702 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms