Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Espl1P60330 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Espl1P60330 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Espl1P60330 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Espl1P60330 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Espl1P60330 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Espl1P60330 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Espl1P60330 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Espl1P60330 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Espl1P60330 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Espl1P60330 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Espl1P60330 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Espl1P60330 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Espl1P60330 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Espl1P60330 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Espl1P60330 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Espl1P60330 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Espl1P60330 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Espl1P60330 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Espl1P60330 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Espl1P60330 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Espl1P60330 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Espl1P60330 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Espl1P60330 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Espl1P60330 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Espl1P60330 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Espl1P60330 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Espl1P60330 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Espl1P60330 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Espl1P60330 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Espl1P60330 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Espl1P60330 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Espl1P60330 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Espl1P60330 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Espl1P60330 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Espl1P60330 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Espl1P60330 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Espl1P60330 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Espl1P60330 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Espl1P60330 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Espl1P60330 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Espl1P60330 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Espl1P60330 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Espl1P60330 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Espl1P60330 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Espl1P60330 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Espl1P60330 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Espl1P60330 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Espl1P60330 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Espl1P60330 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Espl1P60330 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms